امروزه آلودگی هوا یکی از مهم‌ترین مشکلات زیست محیطی کلان‌شهرها محسوب می‌شود و با توجه به وجود هوای سرد و پدیده فرآیند وارونگی دما، نیروگاه گازی خلیج فارس نیز سختگیرانه‌ترین استانداردهای در نظر گرفته شده برای صنایع را ‌طی می‌کند، به همین جهت کمترین میزان آلایندگی نیز برای این نیروگاه به ثبت رسیده است.